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T他提供以下信息供内部印第安纳大学布卢明顿分校IUMSC用户。雷竞技官方网站下载合作者不是位于大学校园应该联系iumsc@indiana.edu详情在外部使用的设施。 内容介绍设施。IUMSC是服务和研究单位化学系,雷竞技官方网站下载,布卢明顿校区。成立的部门协助教师在部门内使用x射线衍射技术获得结构信息。 IUMSC的实验室位于四楼的被称为“64”添加化学构建复杂的大学校园。公共设施是通过入口。A421,位于南部的西部走廊。“旅游”的实验室可从“虚拟实验室参观”这个网站的页面。 该设施是配备由专业训练与研究人员合作的晶体学家们谁可以与x射线衍射的方方面面。接待员有A421回答问题和直接查询到合适的人。 实验室通常从上午8:00 -下午5:00在星期一到星期五开放。因为周二早上举行员工会议,实验室通常不开,直到上午11点。如果条目门是锁在其他时候用户欢迎,但请尽量减少员工中断。因为实验室在连续的基础上运作,专业人员经常出席小时其他那些上面说。研究人员需要访问工厂晚上和周末可以发布了钥匙。 房间A421包含各种各样的电脑和其他硬件的使用人员使用设备。计算设施的完整描述如下所示。计算机中可用IUMSC都获得特定目的——晶体数据操作,分子可视化等,和所有的系统可用于“通用”计算(如文字处理,电子邮件,等等)。 除了x射线衍射和计算设施、IUMSC配备显微镜,可以用来检查样品,和分子模型集能够在实验室中使用。复印机和其他“办公室”设备在IUMSC不能用于一般用途(见接待员的如果你需要副本晶体信息在实验室) 答:第一次用户我们强烈鼓励所有用户首次访问设施和说话的董事或一个专业人员之前提交任何样品。由于复杂的晶体学性质和所涉及的安全隐患,大部分工作在实验室执行分配给专业人员之一。甚至研究人员广泛的晶体经验不熟悉IUMSC硬件和计算机系统。是很重要的,用户与员工工作,确保优化利用设施,并确保结果是有意义的,并且适合于被研究的问题。 b .设施提供给用户IUMSC作出一致努力,减少了需要研究人员需要访问实验室(尽管游客总是欢迎!)除了提交新的样品和挑选样品,已经检查了。大多数部门严重的实验室使用设备已经配备了双目立体显微镜检查晶体(联系导演如果你的实验室需要一个显微镜)。在A423偶尔用户有显微镜,研究人员总是鼓励咨询人员对晶体质量。用户在使用前应该问显微镜已排除在精致的样本。 IUMSC已经可用的一些复杂的软件系统设计,以帮助您的解释晶体数据。包括Cerius2可视化建模系统从分子模拟,Inc . SHELXTL PC系统,本地发达XTEL系统数据操作,XMView分子图形,和许多其他项目。此外,常见的晶体数据基地通过计算机在A421是可用的,以及与其他系统连接到网络部门。Scintag粉末衍射分析库可供研究人员提交粉末样品进行分析。 硅谷图形工作站A701可用于所有化学人员需要使用专业图形软件可用。晶体学研究人员需要系统支持(例如XMView,访问CSD数据基地,等等)鼓励接触ITG的细节。细节获得账户在电脑中给出了计算设施,如下。 可以由主管安排利用洞穴系统维护的VR / VE组林德利大厅里查看使用XMView / CMView结构研究的结果。 最后,几乎所有的2500 +的副本报告生成的IUMSC可用IUMSC web服务器(http://iumsc.indiana.edu)。 c .单晶结构分析——咨询和样品提交专业人员总是可用视觉检查晶体和晶体质量提供建议。此外,员工完全理解数据和不能获得设备,以及有局限性。他们可以帮助用户更好地理解当一个绝对可以确定结构,当氢化物可以可靠地定位等。强烈建议所有用户咨询员工在任何时间。作为服务IUMSC没有提供结晶。有几个现成的资源对那些有问题(见,例如,保罗·波义耳有一些优秀的晶体生长的技巧可以从在北卡罗来纳州立大学晶体学设施)。 一般来说,单晶结构分析的样品应该是格式良好的和良好定义的尖锐的边缘和镜面的面孔。光原子结构(即没有原子比Z =重40)应该有一个最低的0.3毫米晶体尺寸。理想晶体等维度的几乎没有可观察到的缺陷,尽管poor-looking样本通常可以获得非常好的结果。空气敏感样品应提交在几个密封管,这样意外接触就不会破坏整个样本。慢慢成长晶体几乎总是更好的质量比增长迅速。做不受晶体真空干燥,可能存在结晶的溶剂。如果晶体似乎变得不透明在干燥(或显示明显的骨折线),他们无疑是失去结晶的溶剂。在这种情况下样本必须保持在母液,和适当的笔记的样品提交表。 当然是人提交样品的优点在晶体上运行一些简单的稳定性测试之前提交样品。它将大大增加成功的可能性调查员工是否意识到任何潜在的问题。 当取得合适的样品,样品提交表单“必须完成剩下的样本在桌上毗邻A423入口门。Pre-numbered样本提交表单位于本示例提交表。表单应该使用最低的数量。这个数字是用来跟踪样品在实验室里,而且应该立即进入研究人员的实验室笔记本。任何问题或请求信息应该总是伴随着这个数字。不删除这些形式从实验室。如果样品是必要撤回,或者是毁了一种形式,要求接待员或专业人员的帮助。注意电子邮件将被发送到研究顾问承认样品的提交,并请求验证的帐号。 d .特殊处理要求样品许多的样品检查IUMSC有特殊处理的需求。年度报告所示,90%的氧气或提交样品水分敏感,进行溶剂损失,温度敏感或以上的组合。随时咨询员工样本的特殊处理要求。如上所述,所有的样品“风险”应提交一式两份的容器中。还请注意,有附加费特殊处理要求。 如果有任何“特殊”风险参与处理或保存样品,一定不仅注意这对样本提交表单,还与一个员工讨论问题。如果样品不能留在IUMSC(即它必须保持在一个实验室drybox,等等),至关重要的是,安排专业人员的讨论。所有用户应该记住,将样本存储在一个位置以外的IUMSC可能导致延迟考试的样本。 我们经常要求新用户从其他实验室利用技术,他们或者他们的合作者一起工作,成功地在他们之前的位置。虽然我们总是愿意听取建议和观察方法,它是不切实际的修改我们的特殊处理技术为每个新用户。超过3000 IUMSC活性样品已经检查,我们相信我们可以处理几乎所有情况。势在必行,然而,用户与员工合作,这样我们完全理解可能遇到的问题。 e .单晶结构测定,调度问题经常出现关于样本的调度。虽然总的原则是第一份,也有例外,很多因素会影响当一个特定样本放置在一种乐器。现在SMART6000就位,大多数样品将在一周内检查。而导演将最终调度管辖范围内,以下是一些注意事项: 一个)。稳定的样品具有优良的光学特性(即形成良好的面孔和形态)可能获得更高的优先级,因为他们最大化时间提供给专业人员和仪器可用时间几乎没有影响。 b。)一些样品可能等到某个工作人员仪器可用时间。特别是类似样品在一个持续的项目。 c。)“紧急”样本将优先考虑如果给出充分的理由(异常)。 d。)样品尤其反应或需要特殊处理,特别是当只有一个样品瓶,可能会推迟到最大化的机会获得一个合适的晶体。前时,他们也会优先安排。 e)。实验室环境条件(高湿度等)可能导致延迟对于某些类型的样品。 F:数据和报告分布传统IUMSC硬拷贝报告通常包含100页的数字和图形数据。这是打算继续提供这样的报告,只要他们证明有用。然而,我们鼓励所有用户切换到严格电子访问的数据和报告。如果要求,完成报告的副本将生成和用户收取复制费用。 获得结构的首选方法是通过数据IUMSC Web服务器。服务器的结果是一个新的计算计划格兰特(办公室信息技术、国际单位),和一个类项目(CS490w)普渡大学计算机科学课程。的细节数据格式和搜索过程是可用的。所有结构完成1990年之后现在位于服务器上的,和正在努力转移所有剩余结构。如果一个结构不可用网络上的数据库,它将被添加在请求(接待员)联系。服务器还允许用户访问的大多数晶体学程序IUMSC使用。用户被鼓励去学习如何使用可用的软件来最大化晶体数据的有效性。 所有用户都将保持明智的通过。电子邮件你的水晶放在goniostat时,当一个初步结构可用,当最后的文件发布。所有数据和结果中生成IUMSC将WWW服务器上发布。这些研究人员希望保密的数据会有密码保护,如果需要将加密和压缩库。请不要请求密码保护和加密除非绝对必要的,因为这样会大大增加管理开销。 G。粉x射线衍射粉末衍射最好称为“指纹”技术用于识别已知的阶段。均匀研磨样品会产生化合物的光谱特征在一个给定的结晶形式。如果样品已经被记录在一个可搜索的数据库,可以拿一个未知的和知道光谱识别它。如果已知的单晶结构,还可以计算光谱的人会获得材料的粉末样品。因此,粉末衍射不仅是一个优秀的工具来识别一个已知的常见的阶段,但可以用来确保大部分样本符合基于单个晶体的光谱研究。 IUMSC可用(房间A423F)一个自动Scintag粉末衍射仪系统。现有的系统界面的使用本地开发的硬件和软件。 提交程序类似于单晶x射线粉末样品的分析。研究人员应填写“粉末衍射样品提交表单”,把它与样品。与单晶过程中,形式不应删除,即使样本撤回。用户请选择默认条件光谱或指定所需的值。任何单一的运行需要20多个小时必须与员工讨论讨论。 IUMSC将与研究人员气敏和/或其他特殊需要,但用户警告说,现有设备不用于non-ambient实验。感冒正在发展阶段,协助用户较低温度的需要。 x射线粉末衍射需要更多比单晶样品分析。用户应提交至少1/2cc尽可能的材料。 IUMSC人员将尝试识别未知材料只要有可能,但是用户警告说,与单晶的研究有重大误解的机会。在所有情况下,原始数据可供研究者得出他们自己的结论。 h .晶体数据库可用除了IUMSC IUMSC WWW服务器上可用的报告,实验室可用以下晶体数据库: 一个)。剑桥结构数据库(CSD)。编译200000有机和有机金属化合物的报道在科学文献中被剑桥晶体数据中心(CCDC)。用户可以搜索数据库为已知化合物,子结构,期刊引文作者,等。一般来说,仔细回顾了晶体的CSD是一个全面的数据库数据。在线手册可供人希望利用CSD。硅谷图形上的CSD可用网络,以及通过UNIX研究系统在单位投资信托(大学信息技术服务)。此外基于Linux PC A423 CSD本地安装。 b。)无机晶体结构数据库(听障)。超过50000的编译不CSD的无机结构。在数据库不一样优雅的CSD,它允许方便地访问许多常见无机化合物和矿物质。“是可以通过IUMSC多个系统。 c。)国家科学和技术研究所(NIST)晶体数据文件。一个编译单元的参数和其他基本的晶体数据在所有报道晶体。减少细胞以及搜索程序给出比较实验与数据库中的细胞。 d。)蛋白质数据库(PDB)。PDB的保管人大分子结构。自1995年以来,这些都是通过CSD搜索。 所有这些数据库都可以从电脑终端位于A421。除了当许可协议允许,一些数据库可能访问使用正确配置工作站连接到网络部门。 关于如何访问和使用数据库的信息可以在IUMSC web服务器。 我。计算设施IUMSCIUMSC包含主要基于英特尔(例如IBM PC兼容的)工作站和硅谷图形工作站。本地修改选择x射线衍射仪由英特尔80486年IBM兼容电脑,控制和SMART6000帧缓冲区是一个400 mhz奔腾III系统。工作站的工作人员由奔腾系统。硅谷图形系统(Idigo Indigo-Elan O2)用于分子可视化。实验室的数据服务器包括一个SG的挑战和网关2000 p5 - 120。 J。仪器IUMSC中可用(非计算机相关)仪器设备主要包括: 专门的x光设备,包括
晶体安装和处理设施,包括
IUMSC包括额外的支持设备
k .安全性和盘后访问到IUMSC因为危害参与电离辐射(x射线),以及开放梁实验是必要的,访问仪器实验室(A423)是受到严格限制的。一般来说,不发出键除了罕见的实例。开放计算和分子可视化领域(A421)通常在白天开放,和钥匙时将这一领域研究人员可以显示演示所需要的。应该强调人钥匙不允许发布入口其他人,他们只使用这些系统,他们已经签出。研究人员与正当需求访问之前必须接受一系列的安全培训是发布了一个关键。 活动在实验室(A421和A423)连续监测摄像机下班后和周末。 l .出版作者和道德问题经常出现关于作者的论文,包括晶体的结果,以及适当的引用的晶体材料。 经常听到一个说法,晶体学只需要一个星期(或更少),而合作者已经花了几个月,如果不是几年准备复合。应该指出,只花了一个星期的原因是专业人员,花费了数百个小时开发和实现所使用的设备和程序。IUMSC是幸运的拥有超过100年左右的晶体在现有员工专业知识。所使用的程序已经编写、修改和更新不断自IUMSC成立于1968年。程序用于驱动goniostat,例如,已经完全重写在过去的20年中,至少四次,由超过6000行代码。 柜台的论点是,一旦收集的所有材料和设备已经开始对于一个给定的合成(当然常规技术员工作),动力学,不是化学家的知识技能,决心用了多长时间合成一种新的化合物。 有几个来源,试图澄清的问题“道德正确”的作者结晶的结果。一般来说,下列标准IUMSC证明足够,并被认为是适当的方式来处理结晶的结果。 1)如果结构信息是一个重要的知识内容的一部分,如果这些信息被派生的主要是由x射线衍射,然后结晶学应该包含在本文作者应该考虑晶体。大多数报纸包括度量参数(即距离和角度)也属于这个类别。专业人员执行的结晶部分研究应该协助准备,和被允许审查出版物使用的结构数据。 2)如果使用晶体学只确认一个结构完善的其他方法(核磁共振,质量规范等),如果没有给出结构细节,只承认是必要的。这可能发生,例如,当一个中间的相对立体化学在一个复杂的有机合成已经确定。在这种情况下,应该允许发布结构晶体如果需要独立调查的结果。 一个相关的问题是,适当的引用。与众多的数据库使用,重要的是,我们适当地引用源。如果用户有任何问题关于引用的任何来源的正确方法IUMSC,他们应该联系的一个专业人员。 |
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