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IUMSC雷竞技官方网站下载印第安纳大学分子结构中心

互惠网络系统中的数据由两个截然不同的部分。结构性结果位于服务器上的数据存储库和一个数据库可用来定位这个存储库中的数据。库的内容通常包括一个“晶体信息文件”(CIF)包含最重要的晶体结构的信息。此外通常有一些其他文件存在,允许用户查看分子使用web界面。

晶体数据分子结构由一组原子坐标为每一个独特的原子晶体,特定元素的身份和信息对称晶体中。坐标数据可以用多种形式表达,包括晶体坐标与笛卡尔坐标。

对称信息包括平移对称以及各种平面对称要素。在某些情况下分子对称性将出席和对称操作需要产生一套完整的分子原子坐标。对于大多数使用的图形IUMSC服务器生成一个完整的分子。



当用户感兴趣的数据输入页面结构,类似于下面的页面将会出现:

数据录入页面(点击可放大图片)




miniJaMM applet

上面的大部分信息是自解释的。miniJaMM applet有点能力有限,但可以用来旋转和检查结构。

由于它的简单性,miniJaMM JaMM系列的链接提供了最快的下载applet。它将显示一个简单的把图像的颜色编码的分子类型的原子存在,并且可以旋转时被压抑的鼠标左键拖动光标在applet窗口。正确的按钮将调整分子以类似的方式。其他三个命令是可用的,令人沮丧的键盘上的键:

“l”标签的原子
“h”标签的氢原子
“r”重置绘画
“秀”结合旋转角度
“?”列表帮助屏幕







JaMM 2 applet

JaMM 2 applet(点击JaMM 2链接低于applet)是目前最通用的applet的支持。JaMM 1 applet仍然可用来支持老的浏览器和只能使用如果您的浏览器不支持JaMM 2 applet。一个视图的JaMM 2 applet左边所示。

顶部部分允许您选择线图,球和棒,或空间填充表示。

第二部分允许您指定专题或球面表示。

第三部分允许您确定原子,确定债券距离,键角的形象。

其他选项包括标签,显示旋转的角度,和氢原子是否应该显示。画线,ORTEP图和图像呈现选项如下所示。

applet的底部的文本窗口列表字母数字输出所需的其他选项。




当画线或ORTEP图按钮被选中时,小应用程序提交的指令流服务器程序将生成的出版质量的结果。返回的结果是在一个单独的窗口,包括分子的jpg图像以及图像和链接到PostScript文件输入甲板被用来生成ORTEP绘画。下面显示了上面的画线和ORTEP图像分子。

画线分子的形象

ORTEP分子的形象

渲染后的图像按钮创建一个射线追踪图像文件要求提交给IUMSC贝奥武夫系统高分辨率渲染。下面描述了输入必要的射线追踪图片:




渲染选项

生成的图像中选择对应于图像类型JaMM 2 applet。画线将产生一个坚持画画,球棍选项将产生一种形象,似乎是塑料制成的球和铝棒,和空间填充选项将创建一个图像交叉表示原子半径的球体。球大小值可以改变是“正常”的一小部分的直径。图像大小是在x和y方向上的比特数对最终的图像。用户可以更改背景颜色在applet(在最终的图像生成)通过改变值使用滑块红/绿/蓝酒吧或直接输入数值。当选择关闭,值将保持,直到用户离开JaMM 2页。




分子的空间填充图像

通过选择空间填充applet并选择“白色背景上呈现”下面的图像生成。

注意页面的底部有一节题为库文件:。本节包含的文件列表放置在存储库的晶体进行了分析。本节的实际内容将随个人口味,以及可用性的信息结构。的一个完整的解释文件中可用数据目录,参观我觉得会有什么数据?页面。






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