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一般来说,所有计算IUMSC完成在IBM微机兼容。因此,大部分的数据文件读取的格式Netscape 7.1可以由IBM兼容的系统。最关键的是ASCII格式的数据。如果一个结构完成IUMSC一直放在IUMSC Web数据图书馆,超链接“nnnnn报告和数据文件”从晶体数据汇总页面将可用的文件列表。以下定义文件的内容,通常是:

IUMSC WWW文件

谨慎!IUMSC Web服务器上的数据都是受美国版权法保护。联系IUMSC之前使用。

  • anything.gif:应该显示一个图像文件,使用正确配置gif观众
  • nnnnn.tab:晶体上的使用ASCII文本文件数据汇总页面
  • nnnnn.crt:笛卡尔坐标的独特的分子
  • nnnnn.sdt:最后的标准数据磁带(SDT)用于IUMSC XTEL图书馆
  • nnnnnA.sdt:SDT包含生成对称信息等。
  • nnnnn.da:与esd的距离和角度
  • nnnnn.xyz:分数坐标(适用于包含在出版物)
  • nnnnn.us:各向异性热参数
  • nnnnn.fo:佛/ Fc清单(打印HPLJ PCL配备打印机)
  • nnnnn.rep:完整的报告没有佛/ Fc表,总结,和数字
  • nnnnn.sum在WP:总结,最有可能的二进制文件,WordStar或类似的格式
  • nnnnn.txt摘要在ASCII格式(没有subsscripts,标)
  • nnnnnlb.zip压缩格式的完整的图书馆(压缩程序)

压缩(nnnnnlb.zip图书馆可以下载IBM兼容的系统使用PKUNZIP和未压缩的。而PKWare EXE实用程序。的共享软件版本而PKWare软件可用XTEL图书馆。下面描述了每个库的文件可用。

雷竞技官方网站下载印第安纳大学分子结构中心邮政编码库。

对于每一个晶体结构决定在印第安纳大学分子结构中心9 nnnnlb压缩库文件。雷竞技官方网站下载邮政保存。这个压缩文件创建使用软件而PKWARE(压缩程序),9025北Deerwood驱动器,棕色的鹿,53223。

所有IBM兼容系统的浓缩和二进制文件。

典型的结构中心图书馆,保存为9 nnnnlb.zip在IUMSC web服务器上包含许多或所有下面列出的文件和定义。注意,每个晶体IUMSC的个人喜好有关文件保存。请注意,下面列出一些文件不可能包含在库。他们被保存为方便晶体,应该熟悉x射线晶体学不言自明。同样重要的是要注意,这些年来的一些文件稍有变化。在大多数情况下,所有旧文件仍兼容程序。

9 nnnn.rep结构中心的报告,由程序MSCREP。这是报告你知道它,没有图形和概要文件。

9 nnnn.sum概要文件报告。新结构将是完美文书写的(几个版本或已使用),WordStar年龄结构。

9 nnnn最终的标准数据磁带(T21F)放在一起,即磁带包含不对称单元的全部内容。它不包含原子晶体的对称性有关。原子晶体对称性可以生成使用SHORTEP有关。

9 nnnna标准数据磁带的后缀,通常包含完整的分子。它已经放在一起使用晶体对称性,通过使用SHORTEP中的构建命令或使用适当的401年,405年和406年的命令。这盘磁带用于ORTEP情节。不同的晶体学家们在IUMSC可能使用不同的术语。JCH,例如,使用T20A ORTEP情节的报告。

9 nnnnaxh这盘磁带又感兴趣的完整的分子,氢原子坐标已经改变碳氢键bondlength加长1.08,各向同性热参数H被设置为0.5。这盘磁带通常是用于空间情节,和ORTEP情节。

如果不对称单元包含不止一个完整的分子,分子+溶剂分子(s),或阴离子和阳离子(s),可能会有文件标签9 nnnnb 9 nnnnc,等等。这些文件创建的便利,晶体可能特别情节的报道。他们都可以再生利用9 nnnn磁带和SHORTEP。

agnost.inp输入文件的AGNOST吸收校正程序。文件包含晶体的取向矩阵,以及晶面指数的水晶和他们的距离一个共同的中心,在cm中,分子的线性吸收系数μ。

agnost.sum从AGNOST概要文件程序。文件包含输入文件的一个副本,马克斯。和最小值和平均值的吸收校正(传播),和μ的值用于计算。

ang.dat文件的角度收集的数据用于晶胞参数测定。QACELL。仔细反思是集中在+和- 2θ。文件包含h, k, l,两个θ,φω,气,和计数格式(3 i5 4 f8.2 I8)。

ang.drx角度寻求在pcp程序创建的文件。文件是用作DIRAX程序的输入。DIRAX索引程序写的德伊森贝赫,阿尔伯特·j·m·学报(1992)25日,92 - 96。

ang.dxoDIRAX程序创建的输出文件。它显示原选择单位细胞由DIRAX,这未必是单位细胞用于结构的解决方案,并细化。

angs.inp输入文件ORTEP情节。文件包含特定的方位角度的观点。

angs.out文件在报告中包含用于ORTEP-plots角度。生成这个文件的策划程序通讯。每次10指令发出一组为特定取向角和保存。出文件。angsA也可能发生。出去,等和ORTEPA一起去。可等文件重命名为和。inp ORTEP跑步之前。

anyda.outANYDA输出程序。文件包含距离和角度不包含在表5。文件通常是编辑和包含在报告如表(n)。

app2kf所使用的文件。这是一个附录表2报告,包含的细节吸收校正。韦斯使用Table2a这个信息。

avoid.out避免文件创建的项目。这个项目当检查完成结构用于区域(空洞)定义糟糕的溶剂分子。这个文件也可以保存为包装表的分子分析。

bmfit.sum文件包含一个总结的最佳分子的两个分子。BMFIT文件创建的项目。这个文件也可以保存为表(n),见下图。BMFIT程序时使用比较相似的分子的结构。

center.lst寻求项目文件收集的集中反映。这个文件是用于定义单元的初始阶段细胞和晶体的晶格。

crystal.acd文件创建的程序水晶也由AGNOS文件用于查看ACROSPIN晶体形状的程序。

crystal.prn一个ORTEP的副本。打印文件。使用的文件显示了晶体形状AGNOST输入。文件用于创建这个阴谋是由程序AGNOS。

data1.sum概要文件从两个数据处理程序中的第一个。DATPRO1。文件包含单位细胞尺寸用于数据处理,本底计数时间,空间群以及劳厄组没有。总结了反射的数量和一些数据的统计处理。空间群灭绝是删除数据的处理和总结显示了空间群的平均强度灭绝以及观察到的最大值的灭绝。文件的空间群data1.ext灭绝。

data2.sum概要文件从第二个数据处理程序,DATPRO2。这个文件包含数据平均的结果的过程。合并的R等效反射给所有equivelent数据和相当于数据被认为是观察。

dis150.inpDIS250输入文件的程序,计算了保税距离和角度输入文件中定义的。

four.inp傅里叶计算程序四个输入文件。

four.sum概要文件从傅里叶计算程序,四个。它包含了max。和分钟值电子密度的部分。

genles.sum概要文件从最后的最小二乘优化循环。文件包含最后R (F), Rw (F),拟合优度,最大值δ/σ最后周期。

lod.dat文件包含关于数据收集的信息参数。保存从pcp程序。

ls.bat批处理文件用于运行傅里叶计算最小二乘优化和差异。

lsin最小二乘计划GENLES输入参数文件。

lsqpln.sum从LSQPLN概要文件程序。包含摘要最小二乘飞机和线计算的化合物。还包含平面间的角度。可以保存为一个表(n)。

矩阵一个3 x 3矩阵用于重建索引数据文件。当这个文件存在可能收集到的数据是使用不同的单位细胞比,最终用于结构的解决方案,并细化。

mu.outμ的输出程序。文件包含的内容如表1的MSC报告:单位细胞内容,计算密度复合,分子量计算的公式,F(000)和线性吸收系数的化合物。

mu.sum从μ概要文件程序。(见上图)

ortep.inpORTEP-plots文件包含输入指令。文件创建的绘图程序通讯使用14指令。文件已经准备好使用有机分子,对于大多数其他化合物需要一些编辑的文件。

out30这个文件是用作表3和4在IUMSC报告。它包含原子坐标,最后各向同性等效热参数,及其标准差。所有原子精制各向异性与各向异性热参数β的以及你的,再次与标准差variance-covariance矩阵的最小二乘计划,获得GENLES。氢原子参数,理想化或精制。

outda这个文件包含表5的报告。表包含所有保税距离和角度的化合物,所计算的程序DIS250和DISANG。

outfo这是最后的附录的佛和Fc的结构。表包含h k, l,佛和Fc最后的最小二乘优化,以压缩格式,准备存款。每个页面包含七列每个高达55行,即385反射/页。注意:F(000)任期结束时列表并不总是正确的。F(000)可以定义为电子的和完整的单位细胞。“神秘的”字符第一页的顶部是激光打印机指令。

pksrch.inp输入文件的峰值搜索程序,PKSRCH。

pksrch.sum概要文件从峰值搜索程序,PKSRCH文件列表的山峰,他们的坐标和峰高。

plots.zip文件主要由JCH使用。文件包含各种输入和标准数据磁带文件用于生成报告中的情节。文件可以使用PKUNZIP情节。zip vn,这给一个字母列表的文件包含在. zip中。(文件发现水疗。可,ORTEP。可,T20A, ang。INP等等)。

pubus这个文件是各向异性热参数的报告,(表4 a和4 b)没有头。β和U。

pubxyz这个文件的位置参数表3在报告中没有标题。的两个“酒吧”文件是有用的编辑出版的结构。

qacell.sum概要文件包含单胞尺寸标准偏差,由最小二乘合适的设置角度仔细集中反射(ANG.DAT)。使用程序是QACELL。

文件的原始数据。从REF.DAT文件创建这个文件。文件包含h, k, l, background1, scantime, peakcount, background2,过滤器使用#,#序列、背景时间和扫描速度。

自述如果该文件存在,它通常包含言论在数据收集有关问题。如果ref.dat文件包含坏的部分,README文件将显示哪些数据行被删除数据处理等。

ref.dat文件包含衍射仪上的数据来衡量。这个文件是用十六进制格式编写的,并且可以使用程序转换为原始文件序言为每个文件包含h反射,k, l, background1, scantime peakcount, background2、过滤。使用,序列号,背景时间和扫描速度。

报告9 nnnn一样。上面描述的代表。

rs.sum概要文件中创建的解决方案结构。它由个人GENLES。和文件从GENLES的顺序运行。文件通常包含注释插入的解决方案和改进过程中晶体。

sdt21输出文件从傅里叶计算最终的区别。这个文件通常是标准数据磁带格式。它包含最后一个原子参数加上峰位于最后的差异映射。注意:因为这个磁带在优化循环输出原子不一定在一起。

soln1最好的解决方案形式的标准数据磁带木尔坦- 78。

spa.inp输入文件用于空间情节。通讯程序创建的文件是通过使用11指令。

性传播疾病文件包含在数据收集标准定期反射测量。PLTSTDS可能被使用的标准程序。

sumry.wp概要文件用于IUMSC报告。如果.wp后缀,总结了使用WordPerfect 5.1。如果后缀ws网(在旧报告)使用WordStar编写。

t20标准最小二乘数据磁带用于输入程序GENLES。文件一般不保存。

t20a标准数据磁带包含感兴趣的分子。参见上面的9 nnnna。这个文件是用于JCH ORTEP情节。

t21t21f最后T21从最小二乘优化程序。注意这个磁带包含所有原子的不对称单位,但不一定是在一起(GENLES项目存在问题)。原子可以放在一起使用SHORTEP程序,通过使用构建指令或合适的401年,405年和406年的指令。

t3二进制文件用于DIS250距离和角度的计算程序。T3包含variance-covariance矩阵的最小二乘计划GEN250 (GENLES)。T3一般不保存。

t4输出文件的最小二乘progarm GEN250。文件是用来创建Fo的附录和Fc,也称为OUTFO或9 nnnn.fo。T4一般不保存。

t6最终的数据文件用于最小二乘优化。文件包含h, k, l,我团体(我),scalefactor #,ρ。ρ是定义为(sin(θ)/λ)* * 2。

t8从最小二乘优化程序GEN250输出文件。包含用于计算电子密度的地图数据。T8一般不保存。

t30最后T30从最小二乘优化程序,GEN250。这个磁带包含最后一个原子参数的标准差。这盘磁带是用来生成OUT30,表3和4的报告。文件,如T30A T30B等中间磁带,他们在晶体的方便保存。

t30f最后T30从最小二乘优化程序,GEN250。这个磁带包含最后一个原子参数的标准差,和用于生成表3和4在报告中. .如果结构精致的“周期性”的方式录音将被放在一起的晶体。

表(n)偶尔报告包含额外的表,如最小二乘飞机,特殊的接触距离,氢键等。

table2a文件使用的韦斯吸收校正数据。

tabout这个文件是表2的报告。它包含的细节数据收集、数据简化,实验设置,和精致的结构。

tape20标准数据磁带作为输入文件几个项目。这不是正常保存。

tape21从最后一个最小二乘优化标准数据磁带。这个磁带包含不对称单元中所有原子的坐标。这个胶带是用于T30F创建表3和4在报告中,一般也是磁带在报告中列入表6。

tape22标准数据磁带包含两个分子的坐标或片段使用BMFIT程序安装在一起。第二个分子的坐标给出第一单元细胞的分子。当策划与通讯程序使用13 n指令将允许第n个原子策划作为一个独立的单位(通常是一个分子在白色和其他红色)。

tors.sum文件包含复合扭转角度。注:1995年5月我们不是扭转角的计算标准偏差。

xtaldt标准数据磁带AGNOS文件创建的项目。它包含顶点的晶体形状用于吸收校正。可以使用ORTEP和特殊ORTEP绘制。输入文件也由AGNOS。

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