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记住互惠网络服务器支持工具研究的合作者晶体学实验室运行它们。出于这个原因,大多数的近6000种化合物是不寻常的或独特的材料只能使用x射线衍射技术的特征。

除了结构正在检查作为正在进行的研究项目的一部分,“共同分子”可用的集合。这个集合(目前300 +结构)设计主要用于教学和位于倒数净主服务器(http://www.recipnet.org)。常见的分子服务器使用一个不同的看法为每一个条目,如下所示。


分子从常见分子服务器(点击可放大图片)


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检查结构

一旦数据条目位于通过使用一个可用的搜索技术,数据录入页面(见晶体数据访问页面)可以用来查看和检查数据表结构。为了让任何JaMM applet的正常工作,必须有一个文件nnnnn.crt出现在目录中。这个文件包含标签,笛卡尔坐标,每个原子的原子序数是策划,和一对键表,表示某个原子的连接。1999年1月后,添加的条目的那个. crt文件还包含对称信息。如果该文件存在,JaMM applet (MiniJaMM JaMM 1和JaMM 2)可以用来查看分子。如果你选择一个数据输入,不显示任何JaMM applet的分子,检查发现存在(看.crt文件报告和数据文件数据输入页面上的链接。

如果nnnnn。crt文件存在和正确,您将能够使用任何JaMM applet,并生成使用JaMM 1和JaMM 2呈现图像。为了查看ORTEP风格图纸,两个额外的文件必须出现在目录中。第一个是nnnnn.sdt文件,“标准数据磁带”互惠网络使用的格式。.sdt包含晶体坐标系中的坐标数据,而不是笛卡尔坐标。此外,它包含对称信息,散射因素,和其他专业的数据所使用的各种程序的IUMSC XTEL图书馆。如果nnnnn.sdt文件存在以及缩短ORTEP输入文件nnnnn.ort,ORTEP画选项将工作(假设这两个文件被正确格式化的)。一般来说,每个数据条目检查确保文件是正确的。

应该强调,ORTEP图纸依赖于上述两个文件的内容。如果分子对称存在,文件将创建包含一个完整的分子。如果阳离子和阴离子存在,文件可能会也可能不会反映这一事实。溶剂位于晶格一般不包括在.sdt和.ort文件,即使他们对水晶包装很重要。试图包含一个“完整的”.crt文件(nnnnnf.crt),所有原子存在于细胞(甚至无序的原子)。最近的结构也将有一个.pdb文件(nnnnn.pdb)。这个文件也是一个笛卡尔坐标文件的形式被RasMol图形软件和插件一致。如果.pdb文件不存在,实用程序是可用的将.crt .pdb文件文件。

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晶体数据文件

除了分子可视化所需的文件,通常有大量文件目前主要使用的晶体或合作者是谁发布的结构数据。下面描述了一些可能存在的文件及其内容:

  • nnnnn.cif
  • nnnnn.crt
  • nnnnnrep.pdf
  • nnnnnrep.doc
  • nnnnn.da
  • nnnnn.doc
  • nnnnn.fo
  • nnnnn.ort
  • nnnnn.rep
  • nnnnn.sdt
  • nnnnn.t21
  • nnnnn.tab
  • nnnnn.txb
  • nnnnn.txt
  • nnnnn.us
  • nnnnn.xtel
  • nnnnn.xyz
  • nnnnnlb.zip
  • mol.gif
晶体信息文件
IUMSC笛卡尔坐标文件(上述)
最终报告的pdf版本
字版的最终报告
表清单保税距离和角度
Word文档摘要信息
清单的观察和计算结构因素
ORTEP输入文件(如上所述)
完整的打印报告(惠普printers-PCL格式)
IUMSC标准数据磁带(如上所述)
最终的数据磁带从去年XTEL最小二乘法。
晶体数据文件数据录入页面上显示
.tab文件的复制——内部使用
ASCII文本版本的nnnnn.doc文件
热原子参数
现在在旧结构——nnnnn.crt一样
部分原子坐标
所有文件在压缩格式(压缩程序)
缩略图的分子

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