在生化网络临界

贴在通过jbollen

J皇家学会界面

研究人员从我们中心,合作纽约州立大学宾厄姆顿大学和皇家研究院Gulbenkian de Ciencia建立了一个数学和计算框架来理解生化网络的可发展性,健壮性和韧性的生物有机体。

在一个纸在《《英国皇家学会界面,路易斯•罗查乔治·j·Klir系统科学教授和Drs。Manuel Marques-Pita和桑托什Manicka(他获得了博士学位从复杂网络和系统Luddy学校),表明存在大量的冗余基因,蛋白质和其他生化组件过程信号。这导致多扰动的鲁棒性,允许生物系统中存在一个稳定或均分动力政权,尽管是由成千上万的生化变量通常导致混沌动力学。

的测量有效的连接由罗查Marques-Pita捕获在自动机网络冗余和本文所示高度预测的生化系统的动力机制,从花的发展在人类乳腺癌。从而增加实证效度的方法几个著名的理论生物学假说:1),开运河生物发展提出增加鲁棒性h沃丁顿2),冗余对提出的可发展性至关重要迈克尔·康拉德3),生物组织存在于一个均分动力政权提出的Stuart Kauffman。新工作进一步连接的三个假设将开运河等同于冗余,提供一个测量有效的基于动态冗余连接,并进一步表明,这一措施非常准确地预测生化网络的动力学机制。

你可以读这篇文章在参考下列链接:

Manicka桑托什,Marques-Pita Manuel罗查Luis m [2022]。”有效连接决定了生物化学的关键动力…继续阅读。

CSBC研究者显示语言兴衰的理性(PNAS)

贴在通过jbollen

这篇文章是长期合作的结果CSBC导演约翰勃伦和马丁,Ingrid van de Leemput, Els渭南瓦赫宁根大学:“理性的兴衰语言”美国国家科学院院刊》上2021年12月,118年(51)e2107848118;DOI:10.1073 / pnas.2107848118

简介:

“后真相时代许多人感到意外。在这里,我们使用大量的语言分析来证明忽略事实论证的崛起也许被理解的更深层次的变化。1850年之后,谷歌图书中使用sentiment-laden的话拒绝系统,同时使用的话与事实的论证稳步上升。在1980年代,这个模式改变,这种改变加速2007年左右,当跨越语言,有关词的频率下降而感情激昂的语言激增,这一趋势的转变从集体主义的个人主义的语言。”

…继续阅读。

CSBC研究者发现自1980年代以来激增认知扭曲

贴在通过jbollen

在发表的一项研究PNAS”,历史语言记录揭示认知扭曲的激增近几十年来,“CSBC Luddy信息学学院的研究人员计算和工程和IU的心理和大脑科学部门同事分析了数以百万计的图书出版在过去的125年里。他们发现,自1980年代以来已经有大量的语言表明“认知扭曲,”思维模式通常出现在内化订单这样的抑郁和焦虑。

本文的结果之间的跨学科合作CSBC成员约翰勃伦,亚历山大•巴伦Marijn十Thij,心理学和脑科学教员洛伦佐Lorenzo-Luaces和劳伦·拉特,日耳曼研究的教授Fritz Breithaupt教务长,瓦赫宁根大学的马丁。

“我们的分析中使用的语言超过1400万本书的集合从1855年到2019年在美国出版,和德国,和说西班牙语的国家,揭示出一个令人不安的模式,”博伦说。“我们看到明显的“曲棍球棒”模式,使用认知扭曲的表情远高于历史水平在最近几十年,其中包括大萧条时期,第一次世界大战和二世,之后下降或稳定的水平在20世纪的大部分时间里。”

可以找到完整的新闻稿在这里

论文全文细节:

历史语言记录的近几十年来认知扭曲 约翰博伦,Marijn十Thij,弗里茨Breithaupt,亚历山大·t·J。巴伦,劳伦。拉特,洛伦佐Lorenzo-Luaces,貂雅伯 美国国家科学院院刊》上 2021年7月, 118年 (30) e2102061118; DOI:10.1073 / pnas.2102061118
…继续阅读。

博士后职位CASCI

贴在通过jbollen

的复杂的自适应系统和计算智能(CASCI)实验室系统科学和工业工程部门,宾厄姆顿大学(纽约州立大学)是接受一个或多个申请全职non-tenure跟踪博士后研究人员进行跨学科研究复杂网络和系统应用于各种社会、生态、生物、医学和健康问题。

最近的工程实验室,由国立卫生研究院资助,NSF和FCT,包括:

任命是全职的12个月里,与潜在的额外延长一年受到资金和令人满意的性能。我们提供具有竞争力的薪资与慷慨的福利。

博士后将教授来监管。Luis M罗查并加入一个动态和跨学科的团队中嵌入跨校社会和生物医学中心的复杂性(CSBC)和复杂系统的中心集体动力学(可可),包括系统科学家、生物学家、计算机科学家、社会学家。为进一步的信息请联系他。

基本条件:博士学位需要在复杂的系统中,网络科学、计算机或计算科学、计算生物学、应用数学、物理学、统计学、人工智能或相关专业;一个强大的背景复杂的系统和网络的分析和建模;和扎实的编程技能必要的处理大数据和开发大规模的模拟。ABD(除了论文)候选人可以申请,但需要博士学位之前开始。

…继续阅读。

祝贺新博士凯莉McClinton !

贴在通过jbollen

祝贺CASCI成员凯利McClinton成功捍卫她的论文题为“计算建模罗马国内艺术和建筑“2021年4月23日。凯利co-supervised了路易斯•罗查和伯纳德·弗里希。她完成了她的博士学位,研究员NSF-NRT跨学科的复杂网络和系统的培训。McClinton博士的研究调查如何计算模型,包括3 d重建,混合介质模型、复杂的系统,和机器学习,展示独特的技术确定相应研究古罗马的支离破碎的材料记录,关注国内罗马艺术和建筑。除了复杂的网络和系统,论文对虚拟遗产、考古学、和艺术的历史。凯莉现在虚拟世界遗产实验室主任助理,今年秋天,凯利将在牛津大学学习和工作在一个项目名为“精英身份在国内空间在罗马。建筑改变和古董年底重新装饰房子”的监督下快乐雅各布教授…继续阅读。

发现生化网络的“主开关”可以解释的影响药物在肿瘤细胞的破坏

贴在通过kemcclin

我们实验室的研究人员合作Luddy学院信息学、计算和工程,皇家研究院Gulbenkian de Ciencia,东北大学开发了一个数学框架,增加我们的解释和控制生化系统的能力,包括那些参与疾病。

在一篇杂志的封面美国国家科学院院刊》上教授(PNAS)信息路易斯•罗查和亚历山大·盖茨(他获得了博士学位从Luddy学校复杂的网络和系统),引入一个有效的图,可以捕捉非线性逻辑冗余在生化网络监管、信号和控制。

正是由于专题(CSBC实验室的一员,他还获得了博士学位从Luddy学校和复杂的网络和系统玄王当前的博士生,和实验室的成员)也在研究这个项目。一起,作者证明方法的效用计算模型的人类癌症细胞,表明有效图揭示了为什么有些癌症药物比另一些更有效的杀死乳腺癌细胞。

你可以阅读完整的细节通过新闻稿如下:

Luddy新闻稿

皇家研究院Gulbenkian de Ciencia新闻稿

你可以在这里读这篇文章:

https://www.pnas.org/content/118/12/e2022598118

*有兴趣联系作者应该直接这样做,通过上面提供的链接。…继续阅读。