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在生化网络临界

J皇家学会界面

研究人员从我们中心,合作纽约州立大学宾厄姆顿大学皇家研究院Gulbenkian de Ciencia建立了一个数学和计算框架来理解生化网络的可发展性,健壮性和韧性的生物有机体。

在一个在《《英国皇家学会界面,路易斯•罗查乔治·j·Klir系统科学教授和Drs。Manuel Marques-Pita桑托什Manicka(他获得了博士学位从复杂网络和系统Luddy学校),表明存在大量的冗余基因,蛋白质和其他生化组件过程信号。这导致多扰动的鲁棒性,允许生物系统中存在一个稳定或均分动力政权,尽管是由成千上万的生化变量通常导致混沌动力学。

的测量有效的连接由罗查Marques-Pita捕获在自动机网络冗余和本文所示高度预测的生化系统的动力机制,从花的发展在人类乳腺癌。从而增加实证效度的方法几个著名的理论生物学假说:1),开运河生物发展提出增加鲁棒性h沃丁顿2),冗余对提出的可发展性至关重要迈克尔·康拉德3),生物组织存在于一个均分动力政权提出的Stuart Kauffman。新工作进一步连接的三个假设将开运河等同于冗余,提供一个测量有效的基于动态冗余连接,并进一步表明,这一措施非常准确地预测生化网络的动力学机制。

你可以读这篇文章在参考下列链接:

Manicka桑托什,Marques-Pita Manuel罗查Luis m [2022]。”有效连接决定了生物化学的关键动力继续阅读。

复杂网络的控制

网络科学使我们理解组织跨学科的复杂系统。然而,有一个需要了解如何控制他们;例如,识别策略恢复病变细胞癌症治疗的健康状态。最近的工作在实地线性控制理论认为,可以预测复杂系统的可控性单独从图形变量之间的交互,而不考虑它们的动态变化。这样的图论方法已经被使用,例如,表明,生物系统更难控制,明显不同于社会或技术系统控制配置文件。许多应用程序使用的方法也被越来越多的从金融生化网络。

今天发表在自然科学报告工作,cnet研究生亚历山大·盖茨和教授路易斯•罗查证明这种基于方法无法描述当介绍了动态可控性。研究计算多变量系统的控制的大型乐团以及现有的系统生物学模型各生物生化调控。…继续阅读。

cnet团队在复杂网络研究广义模块化&系统

媒介复杂系统的模块化可以观察到在网络和动态状态,时间尺度,以应对不同的扰动。在一个论文发表在《物理评论E(快速通信),Kolchinsky,盖茨&罗查提出一个有原则的替代检测社区在静态和动态网络。证明标准的模块化方法措施在静态网络可以被看作是一种特殊情况的测量扰动的传播动力系统。因此,新方法提供了一个强大的工具,用于探索复杂动力系统的模块化组织。…继续阅读。

奖励在CCS 2015

Optimized-IU_poster_5_botscnet的海报“社交机器人在线社交网络的兴起”,埃米利奥费拉拉,偏向Varol, Prashant Shiralkar,克莱顿·戴维斯,菲利波Menczer,亚历山德罗Flammini赢得了最佳海报奖CCS 2015。克莱顿·戴维斯的海报了。结果也会出现在报纸上发表的“社交机器人的兴起”ACM通讯。(在出版社,预印)。

纸”模块化和扰动的传播复杂的动力系统”Artemy Kolchinsky亚历山大·j·盖茨和路易斯•m•罗查和海报”信息理论结构的法国革命”,亚历山大•巴伦西蒙DeDeo和丽贝卡·斯潘赢得额外的奖励。

最后,我们的前博士后科学家布鲁诺Goncalves(现在法国巴黎第六大学的终身教员)收到了青年科学家奖从复杂系统研究人类社会为他贡献社会行为从大规模在线关注和行为数据。这是第二个青年科学家奖cnet (第一个是由菲利普·Radicchi)。

祝贺cnet团队!

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