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CompuCell3D

CompuCell3D主页

CompuCell是一个软件框架multimodel biocomplexity问题的模拟。它已经作为一个正在进行的项目开发的跨学科研究中心Biocomplexity圣母院大学的。biocomplexity我们意味着复杂的结构和行为的研究源于生物(生物物理!)实体的交互(分子、细胞、有机体)。物理和化学过程的复杂的相互作用产生各种各样的时空结构,导致丰富的复杂性,即便是最简单的生物现象。CompuCell目前使用的细胞分类和聚类的“扩展Potts模型”,和“反应扩散方程建立底层细胞反应化学领域,形成典型的模式发现等生物系统越来越多的鸡腿。(从巴黎圣母院CompuCell网站)

组织仿真工具包(TST)

结核菌素主页

组织仿真工具包是一个二维库细胞Potts模型(格兰和装玻璃的1992;理论物理。启。69年,2013),这是越来越多的使用的计算生物学家研究组织模式和发展机制。

PolyWorld

SourceForge.net网站

“Polyworld是最早的和最复杂的人工世界发达的人工生命研究和人工智能,使用计算遗传学、生理、代谢,神经网络,学习,视野,和行为。”(来自SourceForge.net PolyWorld网站)