朱开

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雷竞技官方网站下载印第安纳大学布卢明顿
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电子邮件:kzhu@indiana.edu

我正在参观癌症数据科学实验室,国家癌症研究所

关于

大家好,我是一位博士生计算机科学系雷竞技官方网站下载印第安纳大学布卢明顿教授建议,Cenk Sahinalp(和教授基础水系),在算法和计算生物学。我获得B.Sc.Eng。在计算机科学和技术泰山学院,山东大学,中国。

我感兴趣的一组不同的算法从生物信息学和计算生物学的问题,尤其是在基因组数据压缩的背景下,索引和安全/隐私保护计算。我的研究的主要目的是开发计算方法可以减少内存使用,同时分析大量基因组数据,或者直接让推理处理基因数据的在线。

我的研究是由NSF ccf - 1619081,NIH gm - 108348和单位的精密健康倡议

简历是可用的。

出版物

  • 草图的基因组数据分析算法和查询在一个安全的飞地
    C Kockan K朱,N Dokmai, N卡尔波夫,莫Kulekci, DP半圆,SC Sahinalp
    (RECOMB 2019][BioRxiv][代码]
  • 守恒的改造模式的组合检测识别癌症子网
    朱E Hodzic R Shrestha K, K Cheng CC柯林斯,SC Sahinalp
    (GigaScience][GigaDB][补充][代码]
  • 高通量序列数据的最优压缩表示通过光组装
    朱AA Ginart, J, K,我Numanagić,TA Courtade, SC Sahinalp, DN证交所
    (自然通讯][代码]

教学

  • 2014年秋季:B501理论计算(助理教练)
  • 2015年春季:I201信息学(助理教练)的数学基础
  • 2015年秋季:P536高级操作系统(助理教练)
  • 2016年春季:B503算法设计与分析(助理教练)

专业的经验

  • 谈判给出:草图的基因组数据分析算法和查询在一个安全的飞地
    RECOMB2019年5月,华盛顿,美国。

    高通量序列数据的最优压缩表示通过光组装
    RECOMB-Seq2017年5月,香港;
    φ会议,国际单位,2017年12月。


链接

(GitHub][dblp][谷歌学术搜索][ORCID]
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